显微根尖手术是在牙体牙髓病科进行的门诊手术，借助手术显微镜的放大和照明的作用，利用超声器械、微型手术器械等设备，通过外科手术方式切除患牙根尖部分，同时清除术区感染和坏死组织，并采用优良的生物相容性材料，如生物陶瓷材料，严密封闭根管系统，从而促进软硬组织再生的治疗方法。

牙髓根尖周疾病的首选治疗方法是根管治疗术。但是有的患牙在根管治疗或根管再治疗之后，仍然持续疼痛，或者根尖周的炎症持续存在，而有的患牙因为桩核冠修复体难以获得根管入路，而无法进行非手术再治疗。针对这类疑难病例，就会考虑进行显微根尖手术。